《恶魔的谜语》故事舞台设定在一个名为“10年黑组”的全住宿制女子高中的班级，这个陈源毫不含蓄地说出了自己的要求，这番话，让陈源面前的眼镜少年苍白的脸色更白了，在眼镜少年的心里，还有天台上其他刚才听清陈源那番话的人心里，陈源这样子完全是要霸占少年的光脑不想还了。班级里的12名学生都是由暗杀者构成的，她们全都瞄准了她们的同学——一之濑晴的姓命。即使她的姓命被众多人觊觎，一之濑晴依然发誓一定要活着毕业。另一方面，同样也是准备夺取一之濑晴姓命的暗杀者——转校生东兔角却在一次次接近对方时，渐渐地被晴所吸引。在同学们对晴展开攻击之时，兔角则以保护者的姿态与她们开始了战斗。
