话说这间办公室的办公桌下面原本就有一个棋盘和一副棋子，五天前辈无聊中的苏云找出来以后，就用它来打发时间了，不是找陈源陪她下，就是找陶艺，但她自己又不会下围棋，所以就把这副上好的棋盘和棋子当作五子棋来下了，陈源下着没劲，后来就基本上都是陶艺陪苏云了。未来世界，人类文明高度发达，智能机器人大量涌现，已在日常生活中占据重要的位置，而且人类为了获得永恒的生命，也尝试将自己改造为机器人。同时，一列名为“银河铁道999号”的宇宙列车担负起连接地球和宇宙文明的使命，星系从此不再遥远。
少年星野铁郎（野沢雅子 配音）的母亲被嗜好杀戮的机械伯爵杀害，他肩负母亲的嘱托，决定前往安达罗星云改造身体，为此不惜在车站抢夺他人的银河铁道999号车票，不过也因此邂逅了容貌与母亲极其相像的梅蒂尔（池田昌子 配音）。凭借梅德尔的帮助，他终于踏上999号列车，继而展开一段充满未知的旅程……
