公元2220年，曾经为了保护地球和人类的大和号已在水瓶之海中沉睡了17年之久。而经历了较长一段和平时期的地球，却正面临最大的危机。一个代号为“小瀑布”的黑洞以极快的速度向太阳系靠近，人类赖以生存的蓝色星球行将湮灭。为了寻得一线生机，人类开始实行浩大的移民计划，借助运输船的帮助，人们分批向塞拉姆星系的阿马尔移民。然而在这一过程中，运输船被星际国家联盟的外星生命视作侵略者，继而遭到毁灭性的打击，古代进的妻子阿雪也在最近一次护航行动中失踪。离地球毁灭不足一个月，古代进临危受命成为第三次移民团的护航舰队总司令，全新的大和号也在这次移民中复活登场……就在巨蟒的耐心耗尽，毫无征兆地再次扑咬过来的时候，陈源双脚猛然发力，突然向后暴退七八米，同时，他眉心一束银光射出，在巨蟒紧跟着扑上来的时候，双手将那束银光一抓一拉，形成一道淡银色的波纹迅速向巨蟒的三角型脑袋闪去。
